MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 plasmid pAS9A-2

Total Repeats: 2012

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015561	CGC	2	6	53904	53909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917625
1002	NC_015561	CGG	2	6	53919	53924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917625
1003	NC_015561	CTG	2	6	53929	53934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917625
1004	NC_015561	CGA	2	6	53988	53993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917625
1005	NC_015561	GC	3	6	54028	54033	0 %	0 %	50 %	50 %	333917625
1006	NC_015561	CGC	2	6	54079	54084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917625
1007	NC_015561	CGC	3	9	54114	54122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917625
1008	NC_015561	GGT	2	6	54123	54128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917625
1009	NC_015561	A	7	7	54142	54148	100 %	0 %	0 %	0 %	333917625
1010	NC_015561	CGA	2	6	54156	54161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917625
1011	NC_015561	GCAGC	2	10	54278	54287	20 %	0 %	40 %	40 %	333917625
1012	NC_015561	GCT	2	6	54375	54380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917625
1013	NC_015561	GCC	2	6	54410	54415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917625
1014	NC_015561	TCC	2	6	54476	54481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917625
1015	NC_015561	TG	3	6	54504	54509	0 %	50 %	50 %	0 %	333917625
1016	NC_015561	CGC	2	6	54540	54545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917625
1017	NC_015561	CGG	2	6	54561	54566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917625
1018	NC_015561	CGA	2	6	54573	54578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917625
1019	NC_015561	A	6	6	54580	54585	100 %	0 %	0 %	0 %	333917625
1020	NC_015561	CGAA	2	8	54702	54709	50 %	0 %	25 %	25 %	333917625
1021	NC_015561	CGG	2	6	54765	54770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917625
1022	NC_015561	GAA	2	6	54789	54794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917625
1023	NC_015561	CAAACA	2	12	54813	54824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917625
1024	NC_015561	ACAG	2	8	54843	54850	50 %	0 %	25 %	25 %	333917625
1025	NC_015561	CCG	2	6	54871	54876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917625
1026	NC_015561	C	6	6	54899	54904	0 %	0 %	0 %	100 %	333917625
1027	NC_015561	TTC	2	6	54949	54954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917625
1028	NC_015561	CGA	3	9	54987	54995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917626
1029	NC_015561	ACC	2	6	55026	55031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917626
1030	NC_015561	CGT	2	6	55104	55109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917626
1031	NC_015561	CCG	2	6	55143	55148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917626
1032	NC_015561	TCG	2	6	55154	55159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917626
1033	NC_015561	CGCT	2	8	55188	55195	0 %	25 %	25 %	50 %	333917626
1034	NC_015561	GTC	2	6	55213	55218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917626
1035	NC_015561	CACTG	2	10	55227	55236	20 %	20 %	20 %	40 %	333917626
1036	NC_015561	AGC	2	6	55251	55256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917626
1037	NC_015561	CGA	2	6	55266	55271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917626
1038	NC_015561	TCC	2	6	55285	55290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917626
1039	NC_015561	TGG	2	6	55291	55296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917626
1040	NC_015561	ACC	2	6	55301	55306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917626
1041	NC_015561	GCG	2	6	55370	55375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917626
1042	NC_015561	ACC	2	6	55413	55418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917626
1043	NC_015561	GCGA	2	8	55621	55628	25 %	0 %	50 %	25 %	333917627
1044	NC_015561	GGT	2	6	55644	55649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917627
1045	NC_015561	GGA	2	6	55653	55658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917627
1046	NC_015561	CA	3	6	55684	55689	50 %	0 %	0 %	50 %	333917627
1047	NC_015561	CTA	2	6	55743	55748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917627
1048	NC_015561	GCC	2	6	55924	55929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917628
1049	NC_015561	GTT	2	6	55967	55972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917628
1050	NC_015561	CTT	2	6	56056	56061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917628
1051	NC_015561	CTGAG	2	10	56121	56130	20 %	20 %	40 %	20 %	333917628
1052	NC_015561	AGC	2	6	56150	56155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917628
1053	NC_015561	GAAGG	2	10	56236	56245	40 %	0 %	60 %	0 %	333917628
1054	NC_015561	GAA	2	6	56299	56304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917628
1055	NC_015561	CGT	2	6	56412	56417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917628
1056	NC_015561	AGC	2	6	56428	56433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917628
1057	NC_015561	ATC	2	6	56575	56580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917628
1058	NC_015561	GGA	2	6	56834	56839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917629
1059	NC_015561	TGT	2	6	56854	56859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917629
1060	NC_015561	CGG	2	6	56906	56911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917629
1061	NC_015561	GATA	2	8	56912	56919	50 %	25 %	25 %	0 %	333917629
1062	NC_015561	AGC	2	6	56946	56951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917629
1063	NC_015561	AAG	2	6	56970	56975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917629
1064	NC_015561	AGCG	2	8	56997	57004	25 %	0 %	50 %	25 %	333917629
1065	NC_015561	TCG	2	6	57093	57098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917629
1066	NC_015561	CAA	2	6	57107	57112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917629
1067	NC_015561	GCAA	2	8	57192	57199	50 %	0 %	25 %	25 %	333917629
1068	NC_015561	ACT	2	6	57217	57222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917629
1069	NC_015561	TCG	2	6	57223	57228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917629
1070	NC_015561	GC	3	6	57242	57247	0 %	0 %	50 %	50 %	333917629
1071	NC_015561	ACC	2	6	57404	57409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917629
1072	NC_015561	T	6	6	57433	57438	0 %	100 %	0 %	0 %	333917629
1073	NC_015561	CGATGC	2	12	57608	57619	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333917629
1074	NC_015561	CAG	2	6	57665	57670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917629
1075	NC_015561	CACT	2	8	57691	57698	25 %	25 %	0 %	50 %	333917629
1076	NC_015561	ACCG	2	8	57716	57723	25 %	0 %	25 %	50 %	333917629
1077	NC_015561	GTT	2	6	57783	57788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917629
1078	NC_015561	GAC	2	6	57791	57796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917629
1079	NC_015561	GGC	2	6	57820	57825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917629
1080	NC_015561	ACC	2	6	57882	57887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917629
1081	NC_015561	GACT	2	8	57890	57897	25 %	25 %	25 %	25 %	333917629
1082	NC_015561	TC	4	8	57904	57911	0 %	50 %	0 %	50 %	333917629
1083	NC_015561	G	6	6	57923	57928	0 %	0 %	100 %	0 %	333917629
1084	NC_015561	TGC	2	6	57943	57948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917629
1085	NC_015561	AAC	2	6	58027	58032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917629
1086	NC_015561	AAC	2	6	58054	58059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917629
1087	NC_015561	GAT	2	6	58112	58117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917629
1088	NC_015561	GCC	2	6	58198	58203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917629
1089	NC_015561	CGC	2	6	58214	58219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917629
1090	NC_015561	TGA	2	6	58225	58230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917629
1091	NC_015561	ACG	2	6	58264	58269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917629
1092	NC_015561	AAG	2	6	58282	58287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917629
1093	NC_015561	TCC	2	6	58303	58308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917629
1094	NC_015561	TGC	2	6	58403	58408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917629
1095	NC_015561	ACC	2	6	58427	58432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917629
1096	NC_015561	TC	3	6	58452	58457	0 %	50 %	0 %	50 %	333917629
1097	NC_015561	CGA	2	6	58469	58474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917629
1098	NC_015561	GGT	2	6	58489	58494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917629
1099	NC_015561	GTT	2	6	58607	58612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917630
1100	NC_015561	GCT	2	6	58616	58621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917630
1101	NC_015561	CGG	2	6	58634	58639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917630
1102	NC_015561	GTGG	2	8	58646	58653	0 %	25 %	75 %	0 %	333917630
1103	NC_015561	GAT	2	6	58680	58685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917630
1104	NC_015561	TCG	2	6	58741	58746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917630
1105	NC_015561	GTG	2	6	58776	58781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917630
1106	NC_015561	GGT	2	6	58806	58811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917630
1107	NC_015561	GGC	2	6	58830	58835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917630
1108	NC_015561	GCT	2	6	58836	58841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917630
1109	NC_015561	GGTG	2	8	58848	58855	0 %	25 %	75 %	0 %	333917630
1110	NC_015561	TGCT	2	8	58878	58885	0 %	50 %	25 %	25 %	333917630
1111	NC_015561	GCGGCT	2	12	58945	58956	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333917630
1112	NC_015561	GAT	2	6	58962	58967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917630
1113	NC_015561	TCGTT	2	10	58972	58981	0 %	60 %	20 %	20 %	333917630
1114	NC_015561	GTT	3	9	58985	58993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917630
1115	NC_015561	TGG	2	6	59008	59013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917630
1116	NC_015561	TTC	2	6	59025	59030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917630
1117	NC_015561	GGC	2	6	59036	59041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917630
1118	NC_015561	GTTC	2	8	59042	59049	0 %	50 %	25 %	25 %	333917630
1119	NC_015561	CTT	2	6	59078	59083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917630
1120	NC_015561	GC	3	6	59143	59148	0 %	0 %	50 %	50 %	333917630
1121	NC_015561	TGG	2	6	59152	59157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917630
1122	NC_015561	GT	3	6	59198	59203	0 %	50 %	50 %	0 %	333917630
1123	NC_015561	TCT	2	6	59261	59266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917630
1124	NC_015561	GCG	2	6	59296	59301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917630
1125	NC_015561	CGG	2	6	59314	59319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917630
1126	NC_015561	GTC	2	6	59389	59394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917631
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1128	NC_015561	GCTG	2	8	59446	59453	0 %	25 %	50 %	25 %	333917631
1129	NC_015561	CGG	2	6	59480	59485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917631
1130	NC_015561	TCA	2	6	59505	59510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917631
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1134	NC_015561	GCT	3	9	59580	59588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917631
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1242	NC_015561	TGC	2	6	63320	63325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917631
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1247	NC_015561	CTG	2	6	63514	63519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917631
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1499	NC_015561	CAC	2	6	78260	78265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917648
1500	NC_015561	CA	3	6	78270	78275	50 %	0 %	0 %	50 %	333917648

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